O curso de Mestrado em Ciência Animal tem por objetivo a capacitação, atualização e aprimoramento de profissionais de nível superior para a docência e para a pesquisa, qualificando-os e habilitando-os, na teoria e na prática, para o desenvolvimento de projetos que visem solucionar problemas relacionados a esta área de conhecimento.

As áreas de concentração "Produção Animal" e "Nutrição e Alimentação Animal" vêm atender a uma demanda de técnicos especializados que contribuirão para o desenvolvimento zootécnico do Nordeste brasileiro, particularmente do recôncavo e Estado da Bahia.O mercado potencial para essas áreas de concentração é formado por profissionais de Agronomia, Aqüicultura, Biologia, Engenharia de Pesca, Medicina Veterinária, Oceanologia, Zootecnia e áreas afins. As entidades interessadas seriam universidades, empresas públicas e o setor privado.Nesse sentido, o Curso de Mestrado terá a missão de geração e multiplicação dos conhecimentos com a formação de profissionais altamente qualificados. A demanda observada nas turmas que estão se formando de Agronomia nos últimos anos e nos recém-criados cursos de Engenharia de Pesca e Zootecnia aponta para uma real necessidade de criação de um Curso de Mestrado nas áreas propostas no Estado da Bahia, que têm sido incentivadas pelo Governo do Estado, incluindo a Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado da Bahia.